นอกจากนี้ยังได้มีการจัดตั้งหน่วยงานวิสาหกิจภายใต้ส่วนงาน คือ สถานบริการวิชาการ ตั้งแต่ ปี พ.ศ. 2545 จนกระทั่งในปัจจุบันได้เปลี่ยนมาเป็น ศูนย์บริการวิชาการด้านวิศวกรรมและอุตสาหกรรมเกษตร เพื่อให้มีการทำงานที่ครอบคลุมแบบบูรณาการองค์รวมมากยิ่งขึ้น ทั้งการสร้างองค์ความรู้จากงานวิจัย นวัตกรรม และการให้บริการวิชาการ ตามมติที่ประชุมคณะกรรมการประจำคณะฯ เมื่อวันที่ 17 สิงหาคม 2563 โดยใช้สำนักงานและบุคลากรที่มีอยู่เดิม เพื่อมุ่งสร้างองค์ความรู้และนวัตกรรมใหม่ทางด้านเกษตรและอาหารให้ทันต่อยุคสมัยที่มีการเปลี่ยนแปลงอย่างรวดเร็ว ทั้งการสร้างความร่วมมือกับหน่วยงานภาครัฐและเอกชน รวมถึงการพัฒนาองค์ความรู้ที่มีอยู่เดิมให้มีประสิทธิภาพและสร้างประโยชน์ต่อสาธารณะอย่างยั่งยืนและเป็นรูปธรรม เพื่อตอบสนองความเป็นผู้นำด้านวิศวกรรมและอุตสาหกรรมเกษตร และนำไปสู่การสร้างรายได้กับคณะวิศวกรรมและอุตสาหกรรมเกษตร และมหาวิทยาลัยแม่โจ้ต่อไป
